A Fundação para o Desenvolvimento Científico e Tecnológico em Saúde (Fiotec) foi instituída como uma fundação privada sem fins lucrativos com o objetivo de prestar apoio às funções de ensino, pesquisa, desenvolvimento institucional, científico e tecnológico, produção de insumos e serviços, informação e gestão implementadas pela Fiocruz, conforme expresso no seu Estatuto elaborado com base no que determina a Lei nº 8.958/1994, regulamentada pelo Decreto nº 7.423/2010.
A relação com a Fiocruz está declarada no documento instituidor da fundação de apoio, tornando claro que a finalidade da Fiotec é contribuir para que a instituição apoiada continue sendo a maior instituição em ciência, tecnologia e inovação em saúde da América Latina, o que representa a possibilidade latente de avanços que beneficiarão a população do Brasil e do mundo.
A adequação legal do Estatuto, a renovação periódica do credenciamento junto ao Ministério da Educação (MEC) / Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (MCTIC) e de outros credenciamentos, títulos e certificados evidenciam o esmero em um trabalho que possa potencializar os objetivos propostos em cada projeto.
A Fiotec, ainda, apoia projetos que prestam serviços gratuitos à população, por meio da parceria com a Fiocruz, nas funções de ensino, pesquisa, desenvolvimento institucional, científico e tecnológico, produção de insumos e serviços, informação e gestão. A atuação conjunta busca o alinhamento com a missão da instituição apoiada de fortalecer e consolidar o Sistema Único de Saúde (SUS) e contribuir para a promoção da saúde e da qualidade de vida da população brasileira.
São três os órgãos de administração e fiscalização da Fiotec. Eles contam com participação de membros da Fiocruz que ajudam a garantir o alinhamento no direcionamento estratégico de ambas as instituições. Esses órgãos asseguram à Fiotec sua eficácia e eficiência na execução dos projetos. O Conselho Curador é o órgão de deliberação e orientação superior, compostos por sete membros, que são indicados pelo presidente da Fiocruz e referendados pelo seu Conselho Deliberativo da Fiocruz. O Conselho Fiscal também é referendado pelo Conselho Deliberativo da Fiocruz, mas a sua indicação parte da Presidência da Fiotec, que indica três integrantes para fiscalizar a gestão econômica e financeira da instituição. A Diretoria Executiva é formada por quatro diretores, que conferem um norte institucional. Um dos diretores é escolhido como diretor executivo, responsável por coordenar as atividades da diretoria.
A estrutura organizacional da Fiotec, então, envolve os Conselhos Curador e Fiscal, a Diretoria Executiva, sete gerências e duas assessorias, de forma a qualificar a instituição para a sua finalidade.
A sede da Fiotec está localizada no Rio de Janeiro, no campus Expansão da Fiocruz, facilitando a interlocução com as equipes dos projetos. Com a intenção de ampliar essa proximidade, há, ainda, um escritório localizado em Brasília.
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Organograma

Conselhos e Diretoria
Conselho Curador
Ricardo de Godoi Mattos Ferreira (Presidente do Conselho Curador)
Alex Santos Príncipe
Ana Paula Morgado Carneiro
Fernando Otavio de Freitas Peregrino
Roberto Pierre Chagnon
Solange Siqueira Duarte dos Santos
Valdeyer Galvão dos Reis
Conselho Fiscal
Fábio Rodrigues Lamin (Presidente do Conselho Fiscal)
José Orbílio de Souza Abreu
Vânia Conceição Dornellas Buchmuller
Diretorias
Diretor Executivo
Hayne Felipe da Silva
Diretor Financeiro
Mansur Ferreira Campos
Diretor Administrativo
Marcelo de Amaral Wendeling
Diretora Técnica
Cristiane Sendim
Assessorias
Assessoria de Comunicação
Janaina Campos
Assessoria Jurídica
Liz Mônica Serejo
Gerências
Gerência de Pessoas
Raquel Raad
Gestão da Governança e Qualidade
Luanara Rocha Damasceno
Gerência de Logística
Luisa Cristina Couto da Silva
Gerência de Tecnologia da Informação
Evandro Maroni Gonçalves
Gerência de Administração Financeira e Contábil
Alexandre Valinoti
Gerência de Projetos
Maria Aparecida S. Ferreira