O ano de 2011 foi repleto de conquistas para a Fiotec. A principal mudança ocorreu em julho, quando tomou posse a nova Diretoria Executiva, que assumiu com a proposta de fortalecer uma instituição que já estava em crescimento. O cargo de gerente geral também foi renovado.
Outra novidade foi o lançamento do novo site institucional em setembro, que foi reformulado com o objetivo de proporcionar mais transparência às atividades da instituição. A Fiotec também participou da 29ª edição do Encontro Nacional das Fundações de Apoio às Instituições de Ensino Superior e de Pesquisa Científica e Tecnológica (Confies), realizada em novembro em Manaus, e venceu a candidatura para organizar a edição do evento em 2012, no Rio de Janeiro.