A Fiotec foi a responsável pela gestão financeira e administrativa do projeto que permitiu a produção, aqui no Brasil, da vacina Oxford/AstraZeneca contra a Covid-19. A instituição esteve envolvida na aquisição de equipamentos e insumos que auxiliaram o processo de absorção de tecnologia pelo Instituto Nacional de Imunobiológicos (Bio-Manguinhos/Fiocruz).
Inicialmente, o imunizante era produzido utilizando o Ingrediente Farmacêutico Ativo (IFA) importado, mas hoje a Fiocruz já realiza a produção nacional do insumo, garantindo a distribuição de uma vacina 100% brasileira. A conclusão do processo de transferência de tecnologia, que permite a produção do IFA por Bio-Manguinhos, também fez parte de um projeto gerido pela Fiotec.
Em janeiro de 2022, após parecer favorável da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (Anvisa), a Fiocruz tornou-se oficialmente uma das produtoras do IFA usado na vacina contra a Covid-19. A Fundação entregou as primeiras doses do imunizante 100% nacional ao Ministério da Saúde ainda no início de 2022, marcando na história o momento em que o Brasil alcançou a soberania na produção e fornecimento da vacina contra a Covid-19.