O projeto Profilaxia Pré-Exposição (PrEP), coordenado pelo Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas (INI/Fiocruz) e financiado pela Unitaid, conta desde 2017 com o apoio da Fiotec em seu trabalho que combina a disponibilização de medicamentos anti-retrovirais, para reduzir o risco de infecção, a programas de conscientização e garantia de direitos à população mais afetada pelo HIV.
A iniciativa utiliza uma abordagem sensível e humana no âmbito das políticas públicas nacionais do Brasil, México e Peru. Ao longo desses anos, a Fiotec realizou o suporte a pesquisas que avaliaram a efetividade da PrEP entre adolescentes de Salvador, Belo Horizonte e São Paulo. Hoje, o apoio da instituição se volta ao projeto pela implementação de uma efetiva prevenção ao HIV entre as populações mais afetadas aqui no Brasil e em países da América Latina.